Mikrobioloogia osakonna teadustöö

Teadustöö põhifookus

• Vastsündinute infektsioonid: tekitajate virulentsusmarkerid, vastsündinu sepsise ravi ja vältimise skeemide optimeerimine; antibiootikumide farmakokineetika ja dünaamika ning modelleerimine, kliinilised uuringud
• HIV infektsioon Eestis: levimus populatsioonides, viiruse resistentsusmarkerid, viiruse ja peremeesorganismi omavahelised suhted, kaasuvad infektsioonid, HIV nakatumist mõjutavad inimese ja viiruse geneetilised faktorid
• Inimese mikrobioom sünnist surmani ja selle seos tervisega: mikroobikooslused seedetraktis, suguteedes, suus ja nahal; nende häired erinevate infektsioossete ja mitteinfektsioossete haiguste korral
• Biotehnoloogilised lahendused tervise mõjutamiseks: uute probiootikumide ja sünbiootikumide väljatöötamine laboratoorsetes ja kliinilistes katsetes
• Antibiootikum-resistentsus: resistentsuse levimus, resistentsuse teket mõjutavad faktorid, resistentsuse tekke ennetamine, antibiootikumide ratsionaalne kasutamine
• Vaktsiinvälditavate haiguste monitooring: epidemioloogilised muutused ajas, modelleerimine

Teadusgrandid

• Euroopa Komisjon Horizon2020: Euroopa Laste Kliiniliste Uuringute Koostöövõrgustik (c4c) (professor Irja Lutsar, MMVBS18106R, 01.05.2018–30.04.2024)
• Euroopa Komisjon: Biomeditsiini ja rahvatervise laborite ühtse epideemiavastase uurimisliidu loomine (professor Irja Lutsar, MMVBS23022, 01.02.2023–31.01.2027)
  Projekti ingliskeelne kodulehekülg
• Euroopa Komisjon Horizon2020:  Ühtse tervise kontseptsiooni järgiva tõmbekeskuse loomine Eestis (professor Irja Lutsar, MMVBS23128R, 01.01.2023–31.12.2025) Projekti ingliskeelne kodulehekülg
• Euroopa Komisjon: VERDI – SARS-CoV-2 variandid rasedatel ja lastel (professor Irja Lutsar, MMVBS23269R, 01.05.2023–31.10.2025)

Praegune olulisim koostöö

Eestis – SA Tartu Ülikooli Kliinikumi erinevad asutused ja kliinikud (meestekliinik, naistekliinik, kirurgiakliinik, lastekliinik, nahahaiguste kliinik, sisekliinik, stomatoloogia kliinik, kõrvakliinik, ühendlabor, infektsiooni kontrolli teenistus), TÜ BSMI biokeemia osakond, TÜ ökoloogia ja maateaduste instituut, TÜ MRI, Eesti Geenivaramu, TÜ sotsiaal-teaduste valdkonna sotsiaalpoliitika õppetool, TÜ füüsika instituut, Tallinna Tehnikaülikool, Tallinna Ülikool, Ida-Tallinna Keskhaigla, Lääne-Tallinna Keskhaigla, Põhja Eesti Regionaalhaigla, Tervise Arengu Instituut, Eesti Maaülikool

Rahvusvaheliselt – Cargill Europe (Belgia); Probi AB (Rootsi); Turu Ülikool (Soome); Karolinska Institutet (Rootsi); Granada Ülikool (Hispaania); University Colleage of London, Great Ormond Street Hospital, London (Ühendkuningriik); Penta Foundation (Itaalia); c4c Network; BARN ja enilabAMR võrgustikku kuuluvad kliinikud paljudes Euroopa riikides rahvusvahelise ravimiresistentsuse uuringu raames

Ettevõtlus – Synlab Eesti OÜ, Tere AS, Tervisetehnoloogiate Arenduskeskus AS, BioCC OÜ, Toidu- ja Fermentatsioonitehnoloogia Arenduskeskus, Perfect Cosmetics OÜ, Andre Juustufarm OÜ

Andme- ja biomaterjali kogud

• Inimese Mikrobioota Biopank (HUMB) 
• Eesti Elektrooniline Mikroobide andmeBaas
• HIV positiivsete isikute andmekogu ja biopank (E-HIV)