Veiko Vengerfeldt, 2018, (juh) Reet Mändar, Tiiu Kullisaar, Mare Saag. Apical periodontitis: prevalence and etiopathogenetic aspects (Apikaalne periodontiit: levimus ja etiopatogeneetilised aspektid). Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond.
Kaspar Tootsi, 2017, (juh) Aare Märtson, Jaak Kals, Mihkel Zilmer. Cardiovascular and metabolomic profiling of osteoarthritis (Osteoartroosi kardiovaskulaarne ja metaboloomiline profileerimine). Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond.
Säde Viirlaid, 2011, (juh) Ursel Soomets, Jaak Järv, Ülo Langel. Novel glutathione analogues and their antioxidant activity (Uued glutatiooni analoogid ja nende antioksüdatiivne toime). Tartu Ülikool, loodus- ja tehnoloogiateaduskond.
Kristiina Roots, 2008, (juh) Mihkel Zilmer, Ello-Rahel Karelson. Cationic regulation of Na-pump in the normal, Alzheimer's and CCK2 receptor-deficient brain. Tartu Ülikool, arstiteaduskond.
Inga Soveri, 2006, (juh) Mihkel Zilmer. Renal dysfunction and cardiovascular diseases (Neerude düsfunktsioon ja kardiovaskulaarsed haigused). Uppsala Ülikool.
Stanislav Liskmann, 2006, (sup) Mihkel Zilmer, Olev Salum, Tiiu Vihalemm. Peri-implant disease: pathogenesis, diagnosis and treatment in view of both inflammation and oxidative stress profiling. Tartu Ülikool, arstiteaduskond.
Maigi Eisen, 2002, (juh) Mihkel Zilmer, Helgi Silm, Sirje Kaur. Pathogenesis of contact dermatitis: participation of oxidative stress: a clinical - biochemical study. Tartu Ülikool, arstiteaduskond.
Peeter Tähepõld, 2002, (juh) Mihkel Zilmer, Joel Starkopf, Jarle Vaage, Guro Valen. Myocardial protection by hypertension. Karolinska Instituut.
Ursel Soomets, 2000, (juh) Ülo Langel, Mihkel Zilmer. Development of novel transport peptides and their application in antisense techniques. Stockholmi Ülikool.
Andres Valkna, 1999, (juh) Ülo Langel, Mihkel Zilmer. Interactions of galanin receptor with ligands and G-proteins: studies with synthetic peptides. Tartu Ülikool, arstiteaduskond.
Joel Starkopf, 1997, (juh) Mihkel Zilmer. Oxidative stress and ischaemia-reperfusion of the heart: a clinical and experimental study. Tartu Ülikool, arstiteaduskond.
Triin Parik, 1996, (juh) Mihkel Zilmer, Rein Teesalu. Oxidative stress in essential hypertension: associations with metabolic disturbances and the effects of calcium antagonist treatment. Tartu Ülikool, arstiteaduskond.