Biokeemia osakonna teadustöö

 

Meie teadustöö integreerib metaboloomika, biokeemia ja veresoonte funktsionaal-struktuursed uuringud siirdemeditsiinilisteks väljunditeks haiguste ennetamise, diagnostika (sh ka subkliinilise) ja täpsema ravi arendamise jaoks. Kliinilise metaboloomika, biokeemiliste meetodite ja arterite funktsionaal-struktuursete uuringute integratsioonina oleme teadustegevust arendanud viimasel kahel aastal nii, et järgmise kuue aasta koondväljund annaks kaaluka panuse uudse siirdemeditsiinilise teadusplatvormi (arterioboloomika) arendamisele. Põhifookuses on südame- ja veresoonkonnahaigused (eeskätt alajäsemete arterite ateroskleroos), esmase episoodi psühhoos ja krooniline obstruktiivne kopsuhaigus (KOK) kui ühed peamised invaliidistumise ja surma põhjused Euroopa Liidus.

 

Praegune olulisim koostöö

Eestis – SA TÜK Endoteeli Keskus, Kopsukliinik, Südamekliinik, Närvikliinik, Nahakliinik, PERH

Rahvusvaheliselt – Cardiff University, Cambridge University, Uppsala University, Macquarie University, Londoni Kings Kolledž, Manchesteri Biotehnoloogia instituut, jt.

Ettevõtlus – BioCC OÜ ning teadus- ja arendustöö Prantsuse firmaga VF Bioscience

 

Andme- ja biomaterjali kogud

Eesti Geenivaramu, Tartu Ülikooli Endoteelikeskuse biopank

 

Patendid

Viimase viie aasta jooksul viis patenti, kokku patente 28 riigis.

 

Viis olulisimat teadusartiklit viimasel viiel aastal

  1. Carolin Kuuskmäe, Mari-Anne Philips, Kalle Kilk, Liina Haring, Raul Kangro, Indrek Seppo, Mihkel Zilmer, Eero Vasar. Kynurenine pathway dynamics in patients with schizophrenia spectrum disorders across the disease trajectory. Psychiatry Res, 2023 Oct:328:115423. doi: 10.1016/j.psychres.2023.115423. Epub 2023 Aug 19.
  2. Ying Xia, Emma Andersson, Sumit K Anand, Emmelie Cansby, Mara Caputo, Sima Kumari, Rando Porosk, Kalle Kilk, Syam Nair, Hanns-Ulrich Marschall, Matthias Blüher, Margit Mahlapuu. Silencing of STE20-type kinase TAOK1 confers protection against hepatocellular lipotoxicity through metabolic rewiring. Hepatol Commun, 2023 Mar 17;7(4):e0037. doi: 10.1097/HC9.0000000000000037. eCollection 2023 Apr 1
  3. Parksepp, M, Haring, L, Kilk, K, Taalberg, E, Kangro ,R, Zilmer, M, Vasar, E. A Marked Low-Grade Inflammation and a Significant Deterioration in Metabolic Status in First-Episode Schizophrenia: A Five-Year Follow-Up Study. Metabolites, 2022 Oct 17;12(10):983. doi: 10.3390/metabo12100983
  4. Parksepp, M, Leppik L, Koch, K, Uppin K,  Kangro R, Haring L, Vasar E, Zilmer M. Metabolomics approach revealed robust changes in amino acid and biogenic amine signatures in patients with schizophrenia in the early course of the disease. Sci. Rep.2020,0:13983,  doi.org/10.1038/s41598-020-71014-w
  5. Kasepalu, T Kuusik, K, Lepner, U, Starkopf, J, Zilmer M, Eha, J, Vähi ,M, Kals, J. Clinical Study. Remote Ischaemic Preconditioning Reduces Kidney Injury Biomarkers in Patients Undergoing Open Surgical Lower Limb Revascularisation: A Randomised Trial. Oxid Med Cell Longev. 2020, doi.org/10.1155/2020/7098505
 Tartu Ülikooli bio- ja siirdemeditsiini instituudi inimese geneetika õppetooli uuring koostöös Tartu Ülikooli Kliinikumi meestekliinikuga näitas, et üllatavalt suurel osal viljatutest meestest on lapsena diagnoositud munandi laskumishäire. Õigeaegne sekkumine aitab tulevikus lahendada viljatusprobleeme ja ennetada haruldaste kasvajate riski.

Poisslaste munandite väärarengu varjus võib peituda hoopis tõsisem geneetiline arenguhäire

Tartu Ülikool uuring näitas, et ühest geeniveast põhjustatud mehepoolne viljatus on arvatust palju sagedasem.

Mehe viljatus tekib arvatust sagedamini ühe geeni veast

Man standing

Ahto Salumets kaitseb doktoritööd „Bioinformatics analysis of various aspects in immunology“