Arstiteaduskonna meditsiinikollektsioon sisaldab hulgaliselt anatoomilisi ja patoanatoomilisi eksponaate. Esimesed preparaadid tõi 1803. aastal prof Isenflamm kaasa Saksamaalt, kui ta tuli Tartusse õpetama. Sellest ajast on Tartu Ülikooli meditsiiniõppes demonstreeritud erinevate patoloogiliste protsessidega makropreparaate. Põhilise osa kollektsioonist moodustavad anatoomia ja patoanatoomia kogud, kuid lisandunud on preparaate ka Tartu Ülikooli Kliinikumi ja Tallinna haiglate erinevatest osakondadest. Kollektsioon on aegade jooksul pidevalt täienenud, sisaldab unikaalseid preparaate ja eksponaatide arv küünib mitme tuhandeni.
Meditsiinikollektsiooni on eksponeeritud Vanas Anatoomikumis, Eesti Spordi- ja Olümpiamuuseumis ning praegu saab seda külastada teaduskeskuses AHHAA.